芽苗菜的生产方式方法很多，有农户的大田生产，也有简易的室内栽培，不管哪种栽培模式与技术，病害与烂种是困扰生产者的头疼问题，如何实现洁净化无病化生产，关键在于工厂化清洁化环境的创造。芽苗菜的烂种原因很多，有种子原因，也有环境气候因子，但更重要的是标准化、流程化、洁净化、工厂化“四化”的建设，只有每个生产环节实现可控化，才能使栽培的产量与质量最终得以确保，最终实现安全化。芽苗菜的工厂化生产是最容易实现有机蔬菜生产的主要方式之一，在每个环节上加以规范与控制就可以轻松实现有机的各种指标。在种子的选择上，通常选用农药污染少，种子质量优的品种作为栽培用种，在生产用水上，可以采用反渗透处理水，也就是用纯水栽培，在管理环节上，运用电功能水及电场等物理手段杀菌，在环境因子上采用计算机控制与空间物理隔离，通过程序上的规范，就可以轻松地生产出完全绿色有机无污染的蔬菜产品。

芽苗菜的工厂化生产，通过立体架模式，使室内耕作效率提高，通过计算机环境控制，使生长因子得以优化，实现预期供货生产，是稳定应市的保障。采用工厂化洁净化的环境创造，使生产过程的病源得以控制，是芽苗菜安全生产的有力保障。在传统生产中化学杀菌剂的使用极为普遍，而且因病菌的抗病性形成，使农药的药效大大降低，导致培育过程的病害滋生与环境污染。而流程化程式化生产制度的形成，定期运用电功能水进行空间场地工具苗体的杀菌消毒，可基本实现生产过程的完全无害化与清洁化，基本做到无烂种无病苗。在环境优化的情况下，苗菜的无基质培育也是实现安全生产的重要技术基础，因传统的基质（如沙培）培育，基质成为病菌的滋生场所，为彻底杀菌带来技术难度，而工厂化无基质化的生产也是克服病害的重要技术保障。

如下图，就是一个标准化生产车间的建设与标准化生产流程的形成。

标准化生产车间

种子电场处理（促进萌芽与杀菌）

电功能水物理消毒

计算机自动化控制

黄化型苗菜生产

绿化型苗菜生产